主要功能用途
Applied Biosystems QuantStudio 3實時熒光定量PCR儀擁有OptiFlex光學(xué)檢測系統(tǒng)和Veriflex溫控?zé)嵫h(huán)模塊,可通過實時采集PCR反應(yīng)體系中的熒光信號,分析樣品中靶序列的有無和初始濃度高低,實現(xiàn)快速、準確、可靠地定性(陰性/陽性)、相對定量和絕對定量(檢測起始模板數(shù)的精確拷貝數(shù))檢測。主要應(yīng)用包括:1、基因表達分析動植物和微生物在生理病理、環(huán)境及外來脅迫下相關(guān)基因表達的變化分析以及SiRNA誘導(dǎo)基因沉默和基因敲除后特定基因表達水平的檢測。2、miRNA表達水平的檢測基于miRNA與特定靶基因mRNA表達水平變化間的關(guān)聯(lián),研究miRNA 調(diào)控基因表達機制。3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)利用TaqMan探針、飽和DNA染料HRM曲線分析進行基因分型,得出等位基因頻率、基因型占總基因型比率等。可應(yīng)用于如遺傳病診斷,SNP基因分型,藥物代謝酶DME基因分型,法醫(yī)遺傳學(xué)鑒定等。4、拷貝數(shù)變異(CNV)拷貝數(shù)變異(Copy number variation, CNV)是指因基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致長度1KB以上的基因片段的缺失(減少)、插入、重復(fù)(增加)、重排、倒 位、DNA 拷貝數(shù)目變化,也稱為拷貝數(shù)多態(tài)性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物種個體差異和人類許多疾病(如癌癥、遺傳性疾病、心血管疾病)的一種重要遺傳基礎(chǔ)。熒光實時定量PCR檢測初始樣品的某個DNA 片段的拷貝數(shù)進行定量,用已知拷貝數(shù)為2的DNA內(nèi)參校正而實現(xiàn)對目標DNA 片段拷貝數(shù)的確認。5、高分辨率溶解曲線分析(High resolution melt, HRM)DNA序列長度、GC 含量及堿基互補性差異影響DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的熱穩(wěn)定性。高分辨熔解曲線(high-resolution melt,HRM) 分析是通過實時監(jiān)測升溫過程中與雙鏈DNA特異性結(jié)合的熒光染料釋放的綠色熒光強度的變化,了解PCR 產(chǎn)物中DNA分子的解鏈溫度情況,分析樣品特定基因片段DNA組成變化。實時熒光定量PCR實驗運行程序中引入溶解曲線分析環(huán)節(jié)后,可借助于專用HRM分析模塊完成HRM分析。HRM用于突變掃描和基因分型,不受突變堿基位點和種類限制,既可對未知突變進行篩查、掃描,又能對已知突變進行分析,還可用于STR分析。6、病原體檢測(Pathogen detection)實時熒光定量PCR儀能可靠用于臨床醫(yī)學(xué)人體上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中樞神經(jīng)系統(tǒng)等疾病,以及畜牧業(yè)、農(nóng)作物病蟲害的病原體的檢測確認、感染嚴重程度的量化評估。7、蛋白熱穩(wěn)定性分析(Protein thermal shift)利用實時定量PCR儀來分析熱穩(wěn)定性,進行配體-蛋白結(jié)合的高通量篩選,突變或修飾對蛋白熱穩(wěn)定性的影響使用蛋白結(jié)合染料(如Protein Thermal Shift 染料),實時定量PCR系統(tǒng)上運行實時熔解實驗,根據(jù)因蛋白熔解導(dǎo)致熒光圖像差異,分析配體與蛋白的結(jié)合穩(wěn)定性。可用于以高通量篩選配體與蛋白的結(jié)合, 篩選能與蛋白靶點結(jié)合的小分子和片段文庫候選藥物、抗體,鑒定最佳緩沖液條件以改善蛋白的純化和分離等。8、食品安全和GMO(genetically modified organism)檢測實時熒光定量PCR技術(shù)用于食品的微生物污染監(jiān)測、肉食類食品食材來源和組成的檢驗、如轉(zhuǎn)基因動植物基因的檢測等。9、耐藥基因檢測等
性能特點
QuantStudio 3實時熒光定量PCR儀體型小巧,既能通過簡單直觀的大尺寸彩色觸摸屏交互式操作,也可以進行常規(guī)PC聯(lián)機操作和數(shù)據(jù)處理。
1、多種樣品通量可選同時支持標準和快速反應(yīng)模式:標準模式運行時間不到2小時,快速模式可在30分鐘內(nèi)獲得結(jié)果;QuantStudio 3支持96×0.2mL或 96×0.1mL Fast兩種反應(yīng)模塊;
2、VeriFlex 梯度控溫技術(shù)采用了Veriflex梯度溫控模塊,VeriFlex 模塊Applied Biosystems 96孔模塊采用 VeriFlex 技術(shù),具有三個獨立的溫度區(qū),可實現(xiàn)精準的溫度控制和優(yōu)化。3、先進的OptiFlex光學(xué)系統(tǒng)OptiFlex技術(shù)具有高亮度白光半導(dǎo)體光源和檢測系統(tǒng),確保孔與孔間測試數(shù)據(jù)精確;具有更靈敏數(shù)據(jù)采集性能,可檢測單重分析反應(yīng)中1.5倍的拷貝數(shù)差異,獲得10log線性動態(tài)范圍;具有多重實時熒光定量檢測功能,最多可支持靶標數(shù)可達4個。
4、qPCR 數(shù)據(jù)分析軟件分析軟件具有桌面版和基于Web瀏覽器版,能夠支持云端服務(wù)器平臺,能實時在線通過云平臺進行遠程控制實驗;可選 Applied Biosystems 云端qPCR 數(shù)據(jù)分析軟件模塊,實現(xiàn)強大的分析功能;將實驗數(shù)據(jù)實現(xiàn)云端安全存儲,便于在線分享測試結(jié)果。
5、新型技術(shù)服務(wù)支持由經(jīng)過專業(yè)培訓(xùn)的現(xiàn)場服務(wù)工程師現(xiàn)場安裝SmartStart Orientation 實踐培訓(xùn)套餐使用智能遠程支持工具更快地排除故障和解決問題。
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