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品牌: biomedworld 公司: 沃登醫(yī)學

提供商： 沃登醫(yī)學 服務名稱： 基因組測序

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基因組測序一、基因組測序服務介紹 基因組測序是對已有參考序列（Reference Sequence）的物種的不同個體進行基因組測序，并以此為基礎進行個體或群體水平的差異性分析。通過基因組測序，研究者可以找到大量的單核苷酸多態(tài)性位點（SNP）、拷貝數(shù)變異（Copy Number Variation，CNV）、插入缺失（InDel，Insertion/Deletion）、結構變異（Structure Variation，SV）等變異位點。這在人類疾病及動植物育種研究等方面具有重大的指導意義。 將構建不同長度的插入片段文庫和短序列、雙末端測序相結合的策略進行高通量測序，幫助客戶在全基因組水平上掃描并檢測與重要性狀相關的基因序列差異和結構變異，實現(xiàn)遺傳進化分析及重要性狀候選基因預測，具有重大的科研和產(chǎn)業(yè)價值。 測序深度（Sequencing Depth）測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小（Genome）的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。重測序的個體，如果采用的是Paired-End或Mate-Pair方案，當測序深度在10~15X以上時，基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以保證。全基因組重測序原理圖二、基因組測序服務內容1. 測序提取基因組DNA，進行片段化，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~0.5 Kb），加上接頭, 進行cluster制備，最后利用Paired-End（Solexa）的方法對插入片段進行重測序。2. 數(shù)據(jù)處理測序完成后，經(jīng)過濾接頭等污染后獲得的reads，比對到參考基因組上，進行測序深度、覆蓋度及均一性等產(chǎn)出數(shù)據(jù)的質量評估。3.標準數(shù)據(jù)分析1）一致性序列組裝與參考基因組序列（Reference genome sequence）的比對分析，利用貝葉斯統(tǒng)計模型檢測出每個堿基位點的最大可能性基因型，并組裝出該個體基因組的一致序列。2）SNP檢測及在基因組中的分布提取全基因組中所有多態(tài)性位點，結合質量值、測序深度、重復性等因素作進一步的過濾篩選，最終得到可信度高的SNP數(shù)據(jù)集。并根據(jù)參考基因組序列對檢測到的變異進行注釋。3）InDel檢測及在基因組的分布在進行mapping的過程中，進行容Gap的比對并檢測可信的Short InDel。在檢測過程中，Gap的長度為1~5個堿基。4）Structure Variation檢測及在基因組中的分布目前我公司能夠檢測到的結構變異類型主要有：插入、缺失、復制、倒位、易位等。根據(jù)測序個體序列與參考基因組序列比對分析結果，檢測全基因組水平的結構變異并對檢測到的變異進進行注釋。三、基因組測序服務說明1.樣品純度：OD 260/280值應在1.8～2.0 之間；RNA 應該去除干凈；2.樣品濃度：最低濃度不低于50 ng/μl；3.樣品總量：每個樣品總量不少于15 μg；4.樣品溶劑：要溶解在H₂O或TE (pH 8.0)中；5.樣品運輸： DNA低溫運輸（-20℃）；且在運輸過程中請用parafilm將管口密封好，以防出現(xiàn)污染；6. 若另有疑問歡迎向本公司咨詢，我們將竭誠為您服務。四、基因組測序服務質量承諾1.準確可靠的測序結果；2.專業(yè)權威的分析報告；3.真實的原始實驗數(shù)據(jù)；4.詳細的實驗步驟。