品牌: 61556
公司: 上海境象生物科技有限公司
提供商： Acebiox 服務(wù)名稱： 所有SNP基因分型服務(wù)（MassArray/AS-PCR/PCR-RFLP/HRM/TaqMan probe） 規(guī)格： 根據(jù)檢測基因和位點數(shù)量的不同，價格有所不同
產(chǎn)品詳情請聯(lián)系金山科研平臺微信：jinshanbio SNP分型服務(wù)平臺服務(wù)簡介
SNP分型（或基因突變檢測）的費用與需要分型的SNP位點，數(shù)目以及樣品數(shù)量差異甚大，分型的質(zhì)量與采用的方法各有區(qū)別。 境象生物采用多種SNP分型方法， 包括美國Agena MassArray， 等位基因?qū)Ｒ恍訮CR（AS-PCR），限制性內(nèi)切酶片段多樣性（PCR-RFLP）， 高分辨率熔解曲線分析（HRMA， high resolution melting curve analysis），熒光探針法。我們會根據(jù)您的SNP位點及其上下游序列特征，需要分型的SNP數(shù)目以及樣品數(shù)目確定最佳方案，提供最優(yōu)性價比服務(wù)。
Acebiox SNP 平臺 Acebiox SNP 研究流程1. Agena MassARRAY 原理簡介
美國Agena公司MassARRAY SNP基因分型技術(shù)是基于飛行質(zhì)譜的分型技術(shù)。首先通過PCR將跨越SNP位點的DNA序列擴增出來，然后應(yīng)用單一延伸引物(extension primer)擴增PCR產(chǎn)物。設(shè)計延伸引物時，要求引物的3‘末端距離SNP位點只有一個堿基。進行延伸反應(yīng)時使用雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)，以確保延伸引物只延長一個堿基。延伸產(chǎn)物用飛行質(zhì)譜(TOF, time of flight)進行分析。雖然一個堿基的分子量差別很小，但應(yīng)用特別設(shè)計的飛行質(zhì)譜足以根據(jù)這微小差別進行分型。 MassARRAY的優(yōu)勢是可以進行多重SNP分型，即一個反應(yīng)可同時分型多個SNP位點。該技術(shù)在分析數(shù)百上千個樣品的數(shù)十上百個SNP時具有價格優(yōu)勢。缺點是儀器昂貴。
2. 等位基因?qū)Ｒ恍訮CR（AS-PCR）原理簡介
等位基因?qū)Ｒ恍訮CR的原理是根據(jù)SNP位點設(shè)計某一等位基因?qū)Ｒ恍砸铮沟肞CR只擴增某一個等位基因。舉例說明，等位基因1和等位基因2 在SNP位點分別為C和T，設(shè)計引物時，擴增等位基因1和2的引物分別按照C或T設(shè)計，另一引物相同。在最理想情況下，擴增等位基因1的引物不能擴增等位基因2，反之亦然。但實際上由于基因?qū)Ｒ恍砸镏辉赟NP位點相差一個堿基，二者都可能存在非特異性交叉擴增，即設(shè)計擴增等位基因1的引物可以擴增等位基因2，反之亦然。但多數(shù)情況下錯配擴增的效率比完全互補擴增的效率低。通過在SNP位點外引人額外的錯配或優(yōu)化PCR反應(yīng)體系，可以進一步增大兩者擴增效率的差別。傳統(tǒng)的等位基因?qū)Ｒ恍訮CR通過凝膠電泳來分析PCR產(chǎn)物，進而確定基因型。這種方法雖然經(jīng)濟，但出錯率高。應(yīng)用實時熒光PCR進行等位基因?qū)Ｒ恍訮CR，分型準確。
3. HRM技術(shù)原理簡介
HRM技術(shù)，即高分辨率熔解曲線分析技術(shù) (high resolution melting curve analysis)，是應(yīng)用高分辨率的熒光染料在飽和濃度下對PCR產(chǎn)物進行熔解曲線分析，通過Tm值和熔解曲線的特征形狀，確定SNP基因型，或基因突變。下圖示意A－>C突變的HRM分析結(jié)果。雜合子A/C的熔解曲線可以清晰地與純合子A/A 和C/C分開(左圖)。純合子A/A 和C/C熔解曲線區(qū)別很小，通過圖形處理，二者的區(qū)別也顯而易見(右圖)。熔解曲線分析技術(shù)誕生已久，但傳統(tǒng)的熔解曲線分析技術(shù)因為分辨率低，沒有用于基因突變檢測和SNP分型。高分辨率熔解曲線分析技術(shù)可以分辨一個堿基的區(qū)別，已開始用于基因突變檢測和SNP分型。幾方面技術(shù)的進步提升了熔解曲線分析的分辨率。一是高分辨率熒光染料的發(fā)現(xiàn)。與傳統(tǒng)的熒光染料不同，這些高分辨率熒光染料對DNA聚合酶的抑制作用很小，因而可以在飽和濃度下使用。這就解決了傳統(tǒng)熒光染料在低濃度使用時由于與雙鏈DNA解離后又在DNA分子別處結(jié)合上去，導(dǎo)致熔解曲線峰很寬，分辨率很低的問題。二是精密熒光PCR儀的使用。這些精密熒光PCR儀，溫度控制精密，步距小，而且反應(yīng)孔位之間溫差很小。三是熔解曲線處理軟件的進步。先進的高分辨率熔解曲線處理軟件通過數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換去偽存真，讓單堿基變化造成的熔解曲線的微小變化顯示出來。 要將HRM技術(shù)成功用于基因突變檢測和SNP分型，除了需要滿足以上提到的三個要素外（使用飽和濃度的高分辨率熒光染料，高精密度PCR儀，和卓越的分析軟件），還需要精心設(shè)計引物，盡量拉開不同基因型的熔解曲線區(qū)別；優(yōu)化反應(yīng)體系，使得體系和不同樣本對熔解曲線的影響最小化。 應(yīng)用HRM方法分析成百上千個樣本的幾個SNP位點，具有價格優(yōu)勢。
4. PCR-限制性內(nèi)切酶片段多樣性（PCR-RFLP）原理簡介
PCR-RFLP方法只適應(yīng)那些由于SNP位點的存在導(dǎo)致酶切位點變化的SNP的分型。首先通過PCR將跨越SNP位點的DNA片段擴增出來，然后用可以區(qū)分SNP位點的一個限制性內(nèi)切酶酶切PCR產(chǎn)物。應(yīng)用凝膠電泳或毛細管電泳分析酶切產(chǎn)物，根據(jù)酶切圖譜確定基因型。
服務(wù)使用儀器
分型方法使用儀器Sequenom MassARRAYMassARRAY Genetic Analysis SystemAS-PCR羅氏 LightCycler 480 IIHRMA羅氏 LightCycler 480 II熒光探針法羅氏 LightCycler 480 IIPCR-RFLPABI 9700, 凝膠電泳工作站測序法ABI 9700, ABI 測序儀
接受樣品類型
a) 組織樣品（需提供≥100mg組織。）；b) 體外培養(yǎng)細胞（需提供≥10^6個細胞。）；c) 基因組DNA （需提供≥5ug 基因組DNA）；d) 全血（需提供≥2ml 全血）。 所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應(yīng)足量，以確保樣品寄至公司時，冰塊未完全融化。
價格
詢價
提交數(shù)據(jù)
分型結(jié)果。如需要，可提供所使用方法的原始數(shù)據(jù)。
報告提交時間
10-20個工作日
PCR + RFLP SNP分型服務(wù)（僅適用 Acebiox 的4萬多個SNP產(chǎn)品）
1.服務(wù)簡介境象生物用自己研發(fā)生產(chǎn)的SNP分型產(chǎn)品為您提供SNP分型服務(wù)。您提供樣品，我們提供SNP分型結(jié)果。2.接受樣品類型a)組織樣品（需提供≥100mg組織。必須保存在RNAlater或類似RNA保護溶液中）；b)體外培養(yǎng)細胞（需提供≥10^6個細胞。必須保存在RNAlater或類似RNA保護溶液中）；c)基因組DNA （需提供≥5ug 基因組DNA）；d)全血（需提供≥2ml 全血）。所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應(yīng)足量，以確保樣品寄至公司時，冰塊未完全融化。 3.服務(wù)內(nèi)容與價格
樣品類型
服務(wù)內(nèi)容
價格（人民幣：元）
組織樣品，體外培養(yǎng)細胞，全血
DNA制備，OD260,280測定， 凝膠電泳分析，SNP分型
詢價
基因組DNA
OD260,280測定，凝膠電泳分析，SNP分型
詢價
4.提交數(shù)據(jù)
服務(wù)報告提交下列數(shù)據(jù)：OD260, OD280 讀數(shù)；凝膠電泳分析結(jié)果； 限制性內(nèi)切酶酶切結(jié)果。
5.服務(wù)報告提交時間
收到樣品后10-20個工作日。PCR + 測序 SNP分型服務(wù)
1.服務(wù)簡介
PCR ＋ 測序 SNP分型服務(wù)采用PCR擴增跨越SNP位點的基因組片段，然后通過DNA測序確定基因型。Acebiox 承接所有SNP的基因分型。
2.接受樣品類型
a)組織樣品（需提供≥100mg組織。必須保存在RNAlater或類似RNA保護溶液中）；b)體外培養(yǎng)細胞（需提供≥10^6個細胞。必須保存在RNAlater或類似RNA保護溶液中）；c)基因組DNA （需提供≥5ug 基因組DNA）；d)全血（需提供≥2ml 全血）。所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應(yīng)足量，以確保樣品寄至公司時，冰塊未完全融化。
3.服務(wù)內(nèi)容與價格
樣品類型
服務(wù)內(nèi)容
價格（人民幣：元）
組織樣品，體外培養(yǎng)細胞，全血
DNA制備， PCR，DNA測序
詢價
基因組DNA
PCR，DNA測序
詢價
4.提交數(shù)據(jù)
服務(wù)報告提交下列數(shù)據(jù)：DNA測序結(jié)果, SNP分型結(jié)果。
5.服務(wù)報告提交時間
收到樣品后10-20個工作日。MassARRAY SNP基因型分析--打造最優(yōu)性價比服務(wù)方案!
服務(wù)簡介
MassARRAYSNP基因分型技術(shù)是由美國Agena Bioscience, Inc.（原Sequenom Bioscience Division）公司開發(fā)的基于飛行質(zhì)譜的分型技術(shù)，Acebiox為該公司中國區(qū)授權(quán)服務(wù)商（Agena Certified Service Provider Certificate）。該技術(shù)通過PCR擴增跨越SNP位點的DNA序列，然后應(yīng)用單一延伸引物(extension primer)擴增PCR產(chǎn)物，確保延伸引物只延長一個堿基。延伸產(chǎn)物用飛行質(zhì)譜(TOF, time of flight)進行分析，根據(jù)一個堿基的分子量差別對SNP進行分型，也可做SNP位點等位基因頻率計算。MassARRAY SNP基因型分析可以進行多重SNP分型，即一個反應(yīng)可同時分型多個SNP位點。該技術(shù)分析準確，在分析數(shù)十上百個SNP時具有價格優(yōu)勢。
技術(shù)原理
MassARRAY飛行質(zhì)譜檢測系統(tǒng)基本原理為基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS) 技術(shù)。將制備好的樣品與芯片基質(zhì)共結(jié)晶，將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管，而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發(fā)，由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量，導(dǎo)致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱，從而使基質(zhì)晶體升華，核酸分子就會解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子，產(chǎn)生的離子多為單電荷離子，這些單電荷離子在加速電場中獲得相同的動能，進而在一非電場漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率加以分離，在真空小管中飛行到達檢測器，飛行時間與離子質(zhì)量成正比。MALDI產(chǎn)生的離子用飛行時間（Time-of-Flight,TOF）檢測器來檢測，離子質(zhì)量越小，飛行時間越短。理論上講，只要飛行管長度足夠，TOF 檢測器可檢測分子的質(zhì)量數(shù)是沒有上限的。
圖1 飛行時間質(zhì)譜檢測物質(zhì)分子量的原理
應(yīng)用領(lǐng)域
MassARRAY SNP基因型分析在生物科學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)研究和應(yīng)用等多個領(lǐng)域具有非常好的應(yīng)用前景，為全世界的科學(xué)家們提供優(yōu)質(zhì)的解決方案，獲得了矚目的進展。以下是一些代表文獻：
腫瘤發(fā)病及其相關(guān)SNP研究和腫瘤的診斷Sun Tong, et al. Nature Genetics. 2007; 39(5): 605-613糖尿病、心臟病、帕金森、銀屑病等各種重要疾病Zhang Xue-Jun, et al. Nature Genetics. 2009; 41(2): 205-210Robert Sladek, et al. Nature. 2007; 445(7130): 881-885Minerva M Carrasquillo, et al. Nature Genetics. 2009; 41(2): 192-198流行病學(xué)和病源微生物檢測H. Yang, et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005; 102(21): 7683-7688M Jallow, et al. Nature Genetics. 2009; 41(6): 657-665重要經(jīng)濟和品質(zhì)性狀篩選The Bovine HapMap Consortium, et al. Science. 2009; 324(5926): 528-532
技術(shù)特點高性價比：在所有的SNP分型方法中，價格最低。高準確性：采用尖端的飛行質(zhì)譜的分型技術(shù)，分析精準。廣泛性：超過2000篇SCI文章，包括
Nature, Science等頂尖雜志。高效性：最快2周即可提供完整的實驗報告。設(shè)備儀器
分型方法設(shè)備儀器MassARRAYMassARRAY Genetic Analysis System
圖2 MassARRAY Genetic Analysis System平臺示意圖
樣品類型
所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應(yīng)足量，以確保樣品寄至公司時，冰塊未完全融化。
a)組織樣品（需提供≥100mg組織。）b)體外培養(yǎng)細胞（需提供≥10
6個細胞。）c)基因組DNA （需提供≥5μg 基因組DNA）d)全血（需提供≥2mL全血）價格
SNP分型（或基因突變檢測）的費用根據(jù)需要分型的SNP位點，數(shù)目以及樣品數(shù)量的不同而制定。
提交數(shù)據(jù)
分型結(jié)果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飛行質(zhì)譜分析圖：
圖3 MassARRAYSNP基因分型飛行質(zhì)譜部分分析圖
如需要，可提供所使用方法的原始數(shù)據(jù)。
提交數(shù)據(jù)
10-30個工作日
等位基因?qū)Ｒ恍訮CR（AS-PCR）等位基因?qū)Ｒ恍訮CR的原理是根據(jù)SNP位點設(shè)計某一等位基因?qū)Ｒ恍砸铮沟肞CR只擴增某一個等位基因。舉例說明，等位基因1和等位基因2 在SNP位點分別為C和T，設(shè)計引物時，擴增等位基因1和2的引物分別按照C或T設(shè)計，另一引物相同。在最理想情況下，擴增等位基因1的引物不能擴增等位基因2，反之亦然。但實際上由于基因?qū)Ｒ恍砸镏辉赟NP位點相差一個堿基，二者都可能存在非特異性交叉擴增，即設(shè)計擴增等位基因1的引物可以擴增等位基因2，反之亦然。但多數(shù)情況下錯配擴增的效率比完全互補擴增的效率低。通過在SNP位點外引人額外的錯配或優(yōu)化PCR反應(yīng)體系，可以進一步增大兩者擴增效率的差別。傳統(tǒng)的等位基因?qū)Ｒ恍訮CR通過凝膠電泳來分析PCR產(chǎn)物，進而確定基因型。這種方法雖然經(jīng)濟，但出錯率高。應(yīng)用實時熒光PCR進行等位基因?qū)Ｒ恍訮CR，分型準確。提交數(shù)據(jù)分型結(jié)果。如需要，可提供所使用方法的原始數(shù)據(jù)。報告提交周期收到樣品后10-20個工作日。
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